同體底物基質固態(tài)發(fā)酵利用的培養(yǎng)基是既充當固相，又為微生物生長提供營養(yǎng)的初級農(nóng)作物產(chǎn)物，如麩皮、馬鈴薯、谷子、豆餅以及其他含淀粉和纖維素的農(nóng)作物產(chǎn)品。第二種固態(tài)發(fā)酵罐采用的固體是惰性載體，這些載體可以是天然的，也可以是人工分成的。這些載體材料有珍珠巖、聚氨酯泡沫體、蔗糖渣和聚苯乙烯等。

    固體底物基質固態(tài)發(fā)酵的一個主要的不足之處就是碳源是它們的結構組成部分，在微生物發(fā)酵生長過程中，培養(yǎng)基被分解了，底物容易結塊，孔隙率也降低，結果底物的外形和物理特性都發(fā)生了變化，降低了發(fā)酵過程中的傳質和傳熱。例如，麥片在發(fā)酵過程中由于淀粉的降解和水的揮發(fā)，會導致固體底物變形結塊，結果使傳質和傳熱受到影響。而具有穩(wěn)定結構的固態(tài)載體充當固態(tài)發(fā)酵的固相可以克服這一缺點，從而更有利于微生物的生長和產(chǎn)物產(chǎn)量的增加。例如，采用聚氨酯泡沫體為載體吸附固態(tài)發(fā)酵核酸酶P1時，產(chǎn)量和活力分別比采用麩皮固態(tài)發(fā)酵提高9倍和4倍。

 

 

 

    另外，惰性載體吸附固態(tài)發(fā)酵與固體底物基質固態(tài)發(fā)酵相比，還具有產(chǎn)物提取簡便的優(yōu)點。可以很容易地從惰性載體中提取到胞外產(chǎn)物，而且所得到的產(chǎn)物含有較少的雜質，載體還可以重復使用。例如，利用聚苯乙烯作為載體，以肋生弧茵產(chǎn)生L-谷氨酰胺酶時，產(chǎn)物比采用麥麩粉固態(tài)發(fā)酵時得到的產(chǎn)物黏性要低。另外，前者的產(chǎn)物不含蛋白質污染物，而后者含有多余的淀粉酶和纖維素酶等。

   與固體底物基質固態(tài)發(fā)酵相比，惰性載體吸附固態(tài)發(fā)酵還具有其他很多優(yōu)點，如：能夠對培養(yǎng)基營養(yǎng)成分進行合適的調(diào)節(jié)；容易了解產(chǎn)物中的各成分并進行分析，從而有利于發(fā)酵罐過程的控制以及動力學研究與模型建立等。